二战风云2不存在陆军单位独立开启的自运输选项，所有兵力调动都必须依托运输机、运输船两类专用载具完成装载转运，陆军兵种无法自主切换运输状态，不能脱离对应载具直接开启自动运输模式。游戏内的运输分为兵力投送与物资运输两套独立体系，二者操作入口、前置条件完全不同，不少玩家会混淆两套机制，误以为陆军自带自运输开关，实际需要手动完成部队集结、载具装载再发起运输指令，系统不会自动调度部队完成转运。
兵力空运需要提前建造空军基地并且生产足够数量的运输机，先把需要调动的步兵、摩托化单位、部分轻型炮兵移动到空军基地附近，选中地面部队点击进入选项接入空军基地，系统才会自动完成匹配仓位装载，重型坦克、重炮这类单位无法通过运输机空运，空投落点只能选择平坦陆地，山地、水域不能作为空降目标，运输机本身没有防御能力，航线要避开敌方防空覆盖区域，必要时搭配战斗机护航，防止运载的部队被直接击落损失。空运优势是无视地形，适合紧急增援和敌后突袭，但是运载吨位有限，大规模兵力调动并不适合单纯依靠空运完成。
跨海大规模兵力投放依靠海运，海运同样没有一键自运输开关，玩家需要占领带有海港的城市，升级港口与兵工厂解锁运输船，把陆军部队移动至港口范围执行登船指令，海运可以承载坦克、重炮等全部陆军兵种，单次运载上限远高于空运。港口等级直接决定同时停靠舰船数量，出发前需要备足燃油资源，避免远航途中燃油耗尽船队停滞。登陆分为友方港口卸货和滩头登陆两种模式，滩头登陆阶段运输船会原地停留，极易遭受敌方海军和岸防火力打击，实战中优先用舰队扫清沿岸威胁，分批次投放步兵先建立滩头阵地，再投放重装部队，空载运输船完成卸载后及时撤回后方港口，减少被偷袭损毁的风险。
物资层面的运输拥有半自动化调度能力，入口在城市商业区，商业区升级之后可以解锁陆地运输、空中运输两种物资输送模式，支持设置单次运输或者持续循环运输，能够自动反复转运资源，这套机制只作用于矿石、石油、弹药等物资，不能直接调度作战部队。执行物资持续运输时需要保证出发城市和目标城市之间通路没有被敌军切断，一旦路线遭到阻断运输队列会遭到拦截损失物资，军团城市之间调配军备物资也依靠商业区运输系统，军团产出的军备需要运输回个人城市才能够编组使用。想要提升整体运输体验，还可以研发对应科技，船舶载重、航速、物流相关科技可以直接提高运输吨位、移动速度，降低油料消耗，减少长途作战的后勤压力。
很多新手会产生部队自带自运输的错觉，主要是混淆了陆军行军、物资持续运输和兵力载具运输三种模式，陆军普通行军属于地面自主移动，不属于运输功能，行军过程会持续消耗士气，穿越复杂地形还会减慢移动速度，和借助运输机、运输船的转运机制有本质区别。实战搭配建议为短途陆地调动直接行军，应急支援使用空运，跨海域大规模作战优先海运，物资补给开启商业区持续运输，多套方式互相配合，才能稳定维持战场兵力与物资供给。
